1936 m. gegužės 1 d. atvėrė duris nauja privati moterų ligoninė, kurioje buvo 25 lovos. Jos įkūrėjas buvo prof. P.Mažylis.

1940 m. ligoninė buvo nacionalizuota.

1958 m. ligoninė pavadinta Kauno m. klinikiniais gimdymo namais, kurie iki 1976 m. buvo Kauno medicinos instituto akušerinės - ginekologinės katedros bazė.

Nuo 1989 m. ligoninei vadovauja gyd. Eugenijus Valasevičius. Tais pačiais metais įstaigai suteiktas prof. P. Mažylio vardas.